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便在李基第二元神往花果山而去的时候，洪荒之上，确切的说，是南赡部洲上风云突变，黄河水势忽然暴涨，冲破河堤，四处泛滥，更兼天阴连雨，风雨如晦，雷电共作，更是雪上加霜，火上浇油，到得最后，连带长江，淮河各处水域都泛滥成灾，水势连天，波涛怒涌，冲破城池，肆虐平原，无数的黎民百姓，生灵万物都在这水患之下遭灭顶之灾。
那黄河跟长江乃是横越南赡部洲的两条主要河道，其支流无数，经主要干道上水浪一冲，那无数条纵横交错的河脉纷纷崩破堤坝，冲出的连天波浪好似有灵性一般，只是往那人群密集处冲撞，抑或是将无数肥沃的平原土地淹没，成为沼泽。
正是福无双至祸不单行，水患一生，无数水中的妖兽也借机而起，凭漫天水灾，借风生浪，到处祸害，无数的群落被大水一冲便即溃散，逃得生命的百姓也被水中的妖兽精怪擒杀，一时民生疾苦，怨声震天。
尧帝爱民如子，见得百姓正遭水患，水深火热，便召集文武群官，商议此事，群臣共议，便有鲧应推举而出，受命治水。
那鲧乃是皇帝轩辕子孙，也是天纵奇才，只是有些自命不凡，恃才傲物，自以为是，在帝挚时代也是名动一方的人物，凶名颇著，曾与欢兜，三苗，穷奇并称四凶。也正因为他性情凶戾，自以为是，与三者并不甚相容，是以为恶远不及三者，后便归隐，娶的乃是有辛氏的女儿，名唤女嬉。尧帝见众人对其颇为赞誉，便也欣然相从，派遣使官前去相请。
女嬉三十而未孕，在某日吞白帝月精而孕，是生大禹，胸口有黑子，点点如北斗之形；两足心各有纹路，像个“己”字；耳有三漏；而且长颈、鸟喙、虎鼻、河目、大口，相貌不凡。
大禹从小聪明仁圣，智慧非常，鲧夫妇爱如珍宝，又自无事，便亲自教导。鲧又博学多才，而大禹年龄虽幼，却颇能领悟，尤其喜欢水利跟地理，和鲧平日擅长所专正好一致，于是鲧更加喜爱自己的这个孩子。
便在这日，鲧正在教导大禹，忽听仆从从外进来，说是有人拜访，鲧甚觉奇怪，大抵自他归隐，便少有人来，遂起身来看。
鲧径直来到前厅，便见有一人坐在紫藤椅上，一身贵官装束，身后还站立着两个随从模样的人，正在等候。鲧疾走几步上前，出声问道“几位何来？”
那贵官装束的人站起身来，和声应道“我几人乃是从帝都而至，奉尧帝之命，请大人共商方今水患，以求良策。”
鲧既然身怀治世之才，又岂是能在家久坐之人，听得眼前一行人乃是奉尧帝诏命，来请自己，先就欢快，后听是请自己治理水患，更是自己所长，当下欣然相从，便让女嬉打点行装，跟几人回帝都复命。
鲧跟随几人回帝都，见过尧帝，便着手治水，鲧依据五行相生相克之理，自觉水灾既生，正是以土克水，所谓“兵来将挡，水来土掩”更焚香祈求，祷祝上苍，昊天大帝便派人将天庭中的息壤赐下，授予鲧以平水患。
自此鲧率大量军民，逢水便以息壤铸就堤坝，那息壤能够孳生无穷，每每水高一尺，堤坝便自行增高两尺，当真是天地灵物，颇为神妙。
此法初始实施，却是颇见神效，洪荒上席卷一切的洪水尽数被阻截在一道又一道的巨大堤坝内，只在其中翻滚咆哮，却出不了息壤所围的层层阻隔。那洪荒之上肆虐的洪水虽多，经那息壤衍生无穷，也渐渐平定。人民渐渐便安定下来，对尧帝跟鲧都是赞口不绝，感激涕零。
就在一日，那淮河范围内的浊流好似恼怒了一般，掀起了惊天的巨浪，浪头直接掀起千百丈高，经淮河水域一闹，那黄河长江之水也是惊涛炸涌，波浪兼天，天空之上乌云密布，整整三日不见阳光，层层叠叠的阴云直欲压到地面，其中更有无数的雷火激荡，电蛇狂走，酝酿了数日，狂风大作，暴雨倾盆，跟那连天的波涛一连，便如遮天盖地的都是洪水，上接九霄，下通黄泉。就连那黄河长江入海处的东海之水也瞬间激起千万重波涛，倒灌入河，如此三下相冲，那息壤到底不是当初女娲造人时所用，衍生至此已然是极致，便陆续被冲垮，河堤损毁，洪水重又泛滥，万物生灵重陷水患之中。
眼见多年辛苦毁于一旦，自视甚高的鲧不禁有些目瞪口呆，沿路走来，四处可见漂浮的屋瓦椽木，人兽浮尸，鲧自觉无言再见天下之民，修书一封，便在其中交代了许多后事，自己便在羽山之上自杀身亡。
噩耗传来，尧帝大惊，更兼年事已高，惊怒之下生了一场大病，不过数月便撒手人寰，临死前便将其位传于帝舜。
舜帝即位，首要任务便是治理如今肆虐的洪水，与群臣商议多次，仍旧任用鲧的儿子大禹治水。大禹自幼接受其父教导，鲧临死前留下的遗书里也详细述说了他多年治水的经验，更有他多年勘测的洪荒河道分布细图，也遗留给了大禹。
大禹接了此项重任，正在自己府邸里忧愁，边听家奴还禀告，说是外面来了一个穿白衣的年轻人，而且看样子颇为不俗，大禹正自苦恼，端着那张河道的详图看个不停，听家奴说道，忙令家奴将其请进。
不过片刻，便见一大约十七八岁的青年，面目十分英俊，身穿雪白的长袍，一路足不沾地，长袖飘摇，摇摇荡荡的跟在家奴身后，穿过青石板路，走了进来。
大禹见人进来，慌忙站起身来，那白衣青年冲大禹微微行礼，嘴里说道“贫道稽首了。”
大禹还了一礼，眉目之间的忧色尽数收敛，笑着说道“原来是清修道长，失礼了。”却是这白衣青年一身装束，全然不似个道家之士，倒有几分富家公子形象，是以大禹有此言。
白衣青年笑着应道“道自在心中，不执于皮相外物。”心里对这大禹也是颇为欣赏。
大禹应声而笑“道长言之有理，却不知道长如何称呼，从何处而来啊？”
白衣青年笑着说道“我乃截教上清圣人门下弟子，便唤李基，如今也是天庭紫薇大帝，听闻大人如今领治水之责，不知可有计划？”
这白衣青年正是李基以混沌钟显化的第二元神，正值他往花果山行去之时，那纵横洪荒的滔天洪水就爆发了，李基也无心去花果山，见得百姓疾苦，黎民倒悬，又有无数深水精怪借机行事，残害人群，李基心下不忍，便顺手除去了许多作恶的精怪妖魔，救取了无数的百姓黎民，顺便积累外功，增加功德。
大禹听得眼前这白衣青年自称是圣人门下，又是天庭大帝，不禁肃然，只是李基身受紫薇大帝尊位，通告三界，晓谕众生，大禹肃然之余，却见眼前这人面貌跟流传的紫微大帝相貌颇有出入，心底也泛起几分疑惑。
李基似乎看穿大禹心中所想，笑着说道“大人不必犹疑，此乃我元神显化，因见洪水肆虐洪荒大陆，百姓身受其苦，不得安身，心中有感，特来相助一二。一则昭显我师平日教诲，二则显示天庭德范，行教化之事。”
大禹听李基如此说，心中大定，也是欢快，两人坐定，有婢女奉上果茗，大禹叹了口气说道“计划已然有了，只是行运起来有些难为。”
“大人便言说一二，正所谓一人计短，两人计长，正好我等商议。”
大禹便将其计划一一道来“依我之见，却与我父亲不同，不过是在下流者疏，在上流者凿，总使百川会海”
李基笑着说道“大人计划却是完好，却有一点两点疏漏。”大禹忙出声问道“帝君所言是何事？”
李基接着道“原本令尊大人治水之法虽有偏差，但以息壤阻之，想那洪水虽巨，到底不过凡世浊物，怎禁息壤这等先天宝物制止，正是有妖孽趁机作乱，而这滔天水灾也正是其引发，为那始作俑者。妖孽不除，纵使方法精妙，也自无用，洪水肆虐十几年，阴气大盛，无数山精水魅川妖木怪潜滋暗长，不可究结，远非人力所能抵挡。二则便是你多说之法，其理不差，但你想过没有，要凿开无数山脉，工程何其浩大，而且更有无数息壤所成的河坝，凡间哪有甚东西可以破开，岂不是痴人说梦么。”